Un jour, François rencontra un lépreux sur le chemin. Bien qu'il éprouvât une grande crainte face à cette maladie, il décida de s'approcher de l'homme, de l'embrasser et de l'aider. Il dira plus tard que ce qui lui semblait amer auparavant s'était transformé en douceur pour son âme.
Peu après, alors qu'il priait devant le crucifix de l'église de Saint-Damien, il entendit une voix lui dire : « François, répare mon Église. » Commença alors un chemin de conversion qui transformerait complètement sa vie et celle de l'Église.